Peter Ledaine est allé à l’Institut Lemmens de Louvain, après ses études au Conservatoire municipal de Bruges, où il a obtenu le diplôme « supérieur » d’orgue sous la direction de Chris Dubois, ainsi que des diplômes d’orgue, de pédagogie musicale et de direction de chœur. Il a ensuite complété ses études avec Hans Van Nieuwkoop au Conservatoire Sweelinck d’Amsterdam.
Il est directeur de l’Académie municipale pour la Musique et la Parole à Blankenberge. En tant qu’organiste, il est associé à l’église Saints Pierre et Paul et à l’église des Capucins à Ostende. Dans l’église Saint-Pierre-et-Paul, il joue l’orgue monumental Schijven-Flentrop et l’orgue Thomas de style Silbermann ; dans l’église des Capucins, l’orgue baroque Loncke, construit dans le style flamand du XVIIIe siècle. Il assure également la direction artistique des concerts donnés dans l’église Saint-Pierre-et-Paul d’Ostende.
Il se produit régulièrement dans son pays et à l’étranger et a réalisé plusieurs enregistrements sur CD. Depuis 1993, Peter Ledaine est le chef d’orchestre de l’Ensemble Orlandus.