Als componist schreef Jan meer dan 250 werken, voornamelijk voor kamermuziekensembles, symfonisch orkest en koor. Zijn composities worden wereldwijd uitgevoerd. Jan won meerdere prestigieuze internationale prijzen. Het Koninklijk Filharmonisch Orkest van Antwerpen, Klara (de Belgische klassieke radiozender) en de steden Brugge en Sint-Niklaas behoren tot de organisaties die opdrachten gaven aan deze getalenteerde componist. Geïnspireerd door zowel de klassieke meesters uit het verleden als moderne componisten zoals Lutosławski en Berio, is zijn eigentijdse stijl doordrongen van een diep gevoel voor spiritualiteit en streeft ze ernaar een boodschap van menselijkheid over te brengen.
Als uitvoerder gaf Jan Van Landeghem concerten in Europa, de Verenigde Staten en het Verre Oosten, zowel als solist als met het All’armi Duo en Trio. In 2000 richtte hij samen met zijn echtgenote Jenny Spanoghe het Duo Landini op. Dit duo geeft succesvolle concerten in binnen- en buitenland en maakte verschillende opnames van Jans eigen composities en klassiek repertoire. Samen met vioolbouwers De Neys en Louppe ontwierpen Jan en Jenny de vijf-snarige altviool.
Jan is een veelgevraagd docent en gaf lezingen aan de conservatoria van Bologna, Gent, Hiroshima, Brno, Praag, Mexico-Stad en Montréal. In 1985 werd hij benoemd tot Fulbright Professor aan de Atlanta State University.
Jan is ereprofessor aan het Koninklijk Conservatorium van Brussel, waar hij onder meer Fredérik Neyrinck en Chong Kee Yong onderwees. Hij was bovendien 30 jaar directeur van de Academie voor Muziek, Theater en Dans van Bornem, die de Eerste Prijs voor Beste Academie van België ontving.
In 2018 behaalde Jan de titel Doctor in de Kunsten aan de VUB en het Koninklijk Vlaams Conservatorium van Brussel. Momenteel is hij docent aan de Musica Mundi School in Waterloo.
In september 2025 ontving Jan de Publieksprijs op de Saint Martin’s Church Organ Concertos (Kortrijk, België), voor zijn vertolking van werken van Herman Roelstrate (solo) en Johann Sebastian Bach (met Thomas Slater).